Utilisation de MPI dans les salles A102 et A106

home	accès étudiants

Utilisation de MPI dans les salles A102 et A106

Préparation de `ssh`

Afin d'utiliser MPI, il faut assurer une connectivité ssh directe entre les machines.

Commencez par vous connecter sur chaque machine dans la salle :

toto@a106-01:~> ssh a106-01
The authenticity of host 'a106-01 (172.16.20.121)' can't be established.
RSA key fingerprint is b6:9f:c0:55:2f:8d:da:a3:b5:65:16:2c:a1:09:19:c2.
Are you sure you want to continue connecting (yes/no)? yes
Warning: Permanently added 'a106-01,172.16.20.121' (RSA) to the list of known hosts.
Password: ********
Have a lot of fun...
toto@a106-01:~> exit
logout
Connection to a106-01 closed.
toto@a106-01:~> ssh a106-02

...

Maintenant les identités des machines sont enregistrées dans ~/.ssh/known_hosts et il n'y aura plus de questions ennuyeuses.

Créez une paire de clefs :

toto@a106-01:~> ssh-keygen -t rsa
Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/home/etudiant/toto/.ssh/id_rsa):
Enter passphrase (empty for no passphrase): [tapez quelque chose ici]
Enter same passphrase again: [tapez la même chose ici]

Your identification has been saved in /home/etudiant/toto/.ssh/id_rsa.
Your public key has been saved in /home/etudiant/toto/.ssh/id_rsa.pub.
The key fingerprint is:
4a:46:3f:50:37:2b:5a:83:86:30:6d:49:73:e1:e5:8d toto@a106-01

et autorisez l'utilisation de votre clef publique :

toto@a106-01:~> cp .ssh/id_rsa.pub .ssh/authorized_keys

Maintenant, grâce à ssh-agent vous pouvez vous identifier une seule fois au début de la session et vous connecter plusieurs fois sans fournir votre mot de passe jusqu'à la fin de la session :


toto@a106-01:~> ssh-agent bash
toto@a106-01:~> ssh-add
Enter passphrase for /home/etudiant/toto/.ssh/id_rsa: [tapez la phrase utilisée dans 2]
Identity added: /home/etudiant/toto/.ssh/id_rsa (/home/etudiant/toto/.ssh/id_rsa)
toto@a106-01:~> ssh a106-02
Last login: Thu Jan 27 15:23:30 2005 from a106-01.pedagogie
Have a lot of fun...
toto@a106-02:~> exit

logout
Connection to a106-02 closed.
toto@a106-01:~> ssh a106-02 hostname
a106-02
toto@a106-01:~>

Préparation de l'environnement

Ajoutez la ligne suivante dans votre .bashrc :

export PATH=/home/personnel/balevs/mpich2/bin:$PATH

Ouvrez un terminal et testez :


toto@a106-01:~> which mpiexec
/home/personnel/balevs/mpich2/bin/mpiexec

Si vous avez la même réponse, vous pouvez continuer.

Pour des raisons de sécurité, mpd cherche dans votre répertoire personnel un fichier nommé .mpd.conf. Créer un tel fichier :
```
cd $HOME
touch .mpd.conf
chmod 600 .mpd.conf
```
Maintenant utilisez votre éditeur de texte pour placer la ligne suivante dedans :
```
secretword=<mon mot secret>
```
Ne pas utiliser votre mot de passe !
Maintenant on va lancer MPD en local :
```
mpd &
mpdtrace
mpdallexit
```
La sortie de mpdtrace doit être la machine sur laquelle vous êtes connecté.

Essayez également d'exécuter une commande non-MPI :
```
mpd &
mpiexec -n 1 hostname
mpdallexit
```
Maintenant on va lancer un anneau de démons MPD sur un ensemble de machines. Créer un fichier mpd.hosts contenant les noms des machines, un par ligne. Lancer les démons MPD :
```
mpdboot -n <nombre de démons> -f mpd.hosts
```
Le nombre de démons peut être inférieur au nombre d'hôtes dans le fichier. Vérifier si tout va bien :
```
mpdtrace
mpdringtest
mpdringtest 1000
```
Lancer une commande :
```
mpiexec -n <nombre de processus> hostname
```
Vous pouvez spécifier un nombre de processus supérieur au nombre de démons :
```
mpiexec -l -n 50 hostname
```
Pour plus d'informations sur l'utilisation de mpiexec faites
```
mpiexec --help
```